伊尔-76的缺点主要集中以下几个方面：
1、采用临界翼，运载/起飞重量比低
伊尔-76的机翼、结构比较落后，升力系数较小，升阻比较低一、气动、结构比较落后。由于设计年代较早，伊尔-76仍旧采用比较落后的临界翼，而不是现代新型运输机普遍采用的超临界翼。临界翼让伊尔-76飞机升力较小，同时机翼的结构重量增加，加上飞机大量采用传统金属材料，因此飞机的结构重量较大，载重偏低。前面说过，伊尔-76的最大起飞重量接近200吨，载重只有40吨；而美国的C-17最大起飞重量只有260吨，载重已经超过70吨。前苏联新研制的安-70，由于采用了超临界翼和提高复合材料使用的比例，也让其在最大起飞重量只有130吨的情况下，载重超过35吨。
2、货舱宽度和高度小，装载适应性差
货舱偏小，伊尔-76的货舱尺寸为长20米×宽3.46米×高3.40米，容积为200立方米左右，由于宽度和高度较低，容积相对比较有限。特别是运载新型装甲车辆时就显得比较局促，这些车辆往往装备有齐全的观瞄、附加装甲，体积比较高大。
而C-17的货舱长×宽×高为26米×5.49×4.11米，容积高达500立方米以上。伊尔-76的货舱容积甚至还低于安-70和A400M，后两者的货舱的高度和高度都在4米左右，而长度接近伊尔-76的货舱，因此容积都在300立方米以上。这样伊尔-76在最大起飞重量是安-70和A400M差不多一倍的情况下，货舱容积居然比两者要小近三分之一，所以伊尔-76对于装载适应性是非常落后的。
3、第一代涡扇发动机耗油大、噪声大
伊尔-76采用的D-30KP发动机是第一代小涵道涡扇发动机注意其发动机比较细长三、发动机落后，伊尔-76采用的D-30KP发动机属于第一代小涵道比涡扇发动机，推力小、耗油量大、噪声大，以于许多欧美国家拒绝伊尔-76的降落。
4、航电系统落后
伊尔-76的航电系统落后，仪表多为传统指针式仪表四、航空电子落后，KJ-2000飞行仪表仍旧以老式的指针仪表为主，而KJ-200已经实际上了玻璃化座舱，这种情况下结果就是伊尔-76的空勤人员多达7人，而现代运输机只需要2人。